Hantavirus : le virus du bateau de croisière n’a pas muté, mais en France les cas ont triplé en 2026

Le MV Hondius avait quitté Ushuaïa, en Argentine, le 1er avril. Au fil de la croisière, 13 personnes ont été infectées, dont 12 confirmées par un laboratoire, et trois sont mortes^[1]. En France, une passagère a été touchée et 25 personnes contacts ont été isolées à l’hôpital jusqu’à 42 jours : toutes sont restées négatives^[2]. Sept mois après les premiers cas, la science a reconstitué l’histoire de ce virus, sans en trouver le point de départ.

Hantavirus Andes : un seul passage du rongeur à l’homme, aucun virus « muté »

La première étude, publiée le 12 novembre dans la revue Science, croise les dates de symptômes, les contacts à bord et le génome du virus prélevé chez dix passagers et membres d’équipage. Des laboratoires de sept pays y ont travaillé avec des équipes chiliennes et argentines, dont le Centre national de référence des hantavirus de l’Institut Pasteur^[1][3].

Les génomes se ressemblent presque tous. Huit différences apparentes se sont révélées être des erreurs techniques une fois les résultats recoupés entre laboratoires. Les auteurs en déduisent un seul saut du virus depuis son rongeur réservoir vers le premier malade, puis une transmission entre personnes, limitée, sur le bateau^[3]. Le virus Andes, de son nom savant Orthohantavirus andesense, est le seul hantavirus connu capable de passer d’une personne à une autre^[4].

Aucune des mutations connues pour rendre ce virus plus contagieux ou plus grave n’a été retrouvée. Une seule mutation propre à ce foyer a été repérée, et son effet reste inconnu, a précisé à l’AFP Sarah Temmam, de l’Institut Pasteur. L’étude souligne que cette analyse rapide a permis de contrer les rumeurs d’un virus « muté » ou fabriqué^[3].

« Le virus Andes ne présente pas, à ce jour, un potentiel pandémique comparable à celui du SARS-CoV-2. »

Virginie Sauvage, responsable du Centre national de référence des hantavirus, Institut Pasteur, à l’AFP

Le lieu de la contamination du premier malade reste une énigme

Les premiers malades avaient sillonné l’Argentine et le Chili en camping-car de novembre 2025 jusqu’à l’embarquement. La seconde étude parue dans Science rattache le virus du navire à une lignée qui circule depuis des années dans le nord de la Patagonie argentine : son plus proche parent connu a été retrouvé à plusieurs reprises de 2018 à 2025 autour de Villa Meliquina et San Martín de los Andes. Mais les données ne permettent pas de désigner avec certitude le lieu ni les circonstances de la contamination^[5].

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Une autre équipe, dont le travail n’a pas encore été relu par des pairs, pointe le secteur de Toltén-Lanco, dans le sud du Chili. Problème : le premier malade y était passé 62 à 66 jours avant ses premiers symptômes, au-delà des 7 à 42 jours d’incubation habituellement décrits^[6]. D’où la demande des auteurs de l’étude principale : analyser davantage de rongeurs dans les zones traversées avant l’embarquement^[3]. Le même raisonnement guide la surveillance d’autres virus animaux, comme la grippe aviaire chez les visons de l’Utah.

En France, l’hantavirus du campagnol a déjà fait 89 malades en 2026

Le virus Andes ne circule qu’en Amérique du Sud. En France hexagonale, c’est surtout le virus Puumala, porté par des campagnols qui vivent en forêt mais aussi dans les granges, greniers, remises et cabanes abandonnées. Ces rongeurs restent en bonne santé et rejettent le virus dans leurs urines et leurs crottes. On s’infecte en respirant des poussières souillées, et ce virus ne se transmet pas d’une personne à l’autre^[4].

La maladie, une fièvre hémorragique avec syndrome rénal, va d’un état grippal avec de fortes douleurs musculaires à une insuffisance rénale, qui guérit le plus souvent. Sa létalité est de l’ordre de 0,4 % pour le Puumala, contre jusqu’à 60 % pour les formes pulmonaires américaines dues aux hantavirus comme l’Andes. Il n’existe ni vaccin ni traitement spécifique^[4].

De 2005 à 2024, le Centre national de référence a confirmé 2 046 cas contractés en France, avec de fortes variations : 14 en 2013, 320 en 2021, 108 en moyenne de 2012 à 2023^[2]. Ces années « épidémiques » suivent la population des rongeurs^[4]. 2025 avait été calme, avec 28 cas. De janvier à août 2026, le centre en a déjà compté 89, soit environ trois fois plus, et déjà davantage que sur toute une année depuis 2021 ; le mois d’août se situait encore un peu au-dessus de la moyenne^[7].

Ardennes, Aisne et Nord concentrent 72 % des cas, mais la zone s’étend

Sur les 86 cas de 2026 situés par département, 25 viennent des Ardennes, 20 de l’Aisne et 17 du Nord^[7]. Rapporté à la population, l’écart est net : 9,5 cas pour 100 000 habitants dans les Ardennes en huit mois, 3,9 dans l’Aisne, 0,65 dans le Nord (calculs de la rédaction). Au total, 17 départements ont eu au moins un cas cette année, de l’Oise au Rhône^[7].

Depuis 2017, la zone du virus Puumala s’étend vers le sud et l’ouest : 43 départements ont déjà eu au moins un cas, contre 31 en 2015^[2]. Et la carte bouge d’une année à l’autre : en 2021, le Jura avait compté 134 cas et le Doubs 71, contre 2 et 1 cette année^[7].

L’outil ci-dessous retrouve le nombre de cas confirmés dans votre département, année par année depuis 2021.

Cabanon, grenier, tas de bois : les gestes avant de nettoyer

Les situations à risque sont connues : manipuler du bois, nettoyer un local longtemps fermé, rénover une vieille pièce poussiéreuse^[4]. Les cas culminent à la fin du printemps^[2].

Avant et pendant le nettoyage d’un local resté fermé

1. Aérer au moins une demi-heure avant d’entrer nettoyer, et laisser ouvert pendant le ménage^[4][8].
2. Mettre un masque et des gants en caoutchouc ou en latex^[4].
3. Mouiller avant de nettoyer : asperger le sol d’eau, ou mieux d’eau de Javel diluée ou de désinfectant, pour fixer la poussière^[4][8].
4. Jamais de balai à sec ni de jet à haute pression : Santé publique France conseille l’aspirateur plutôt que le balai^[4].
5. Rongeur mort ou nid : le ramasser avec des gants, le placer dans un sac plastique fermé dans un second sac, puis se laver les mains au savon^[8].

Pour la suite, Santé publique France recommande d’empêcher les rongeurs d’entrer, de ranger les aliments hors de leur portée, de retirer les abris comme les tas de bois près de la maison, et de couvrir une plaie avant de manipuler du bois ou de la terre^[4]. Et si vous entendez plutôt gratter dans les cloisons, voici comment savoir s’il s’agit d’une souris ou d’un rat.

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Signalez alors au médecin l’activité en cause ou la présence de rongeurs : le diagnostic passe par une prise de sang^[4].